De kleur van honing is het pakkende verhaal van een meisje van vijf dat samen met haar kleine zusje door hun moeder achtergelaten wordt, in het centrum van de miljoenenstad Rio de Janeiro. Vanaf dat moment moet ze leren overleven: op straat, in het weeshuis waar ze later terechtkomt, daarna in een busdepot.
Er is niet veel hoop voor haar, tot ze op een dag voor een oudere dame wat klussen mag doen. Langzamerhand begint haar leven te veranderen.