Het Hospitaalmuseum omvat twee unieke locaties: het Sint-Janshospitaal en Onze-Lieve-Vrouw-ter-Potterie, beiden gevestigd in een middeleeuws hospitaal. Het Sint-Janshospitaal is wereldbekend omwille van zijn vermaarde verzameling schilderijen van Hans Memling en een volledig bewaard gebleven zeventiende­eeuwse apotheek. Wat de collecties van het Sint-Janshospitaal en het Potteriemuseum bovendien zo uniek maakt is dat ze getoond worden in hun oorspronkelijke context. Memling schilderde zijn meesterwerken in opdracht van het Sint-Janshospitaal, en daar hangen ze nog steeds.