Rond 1555 woont er in het noorden van Peru een Muchillastam. Het is een vreedzaam volk dat leeft met de natuur als voedingsbodem, en de zon, maan en sterren als grote levenskracht. Ataranka is een jonge Muchillavrouw die haar inwijding ontvangt in Negredo, een heilige boom waar zij drie dagen en drie nachten in afzondering doorbrengt. Tijdens deze overgangsrite worden haar familie en overige stamleden op brute wijze vermoord. Ataranka vlucht naar het zuiden, een groot geheim met zich meedragend. In de Heilige Vallei vindt zij een schuilplaats bij de wijze Manu. Manu leert haar alles over de natuur, de aarde, de kruiden, de zon en de hemelse rivier Mayu. Hij geeft haar zijn kennis en rituelen door. Als na vele jaren de tijd is aangebroken vertrekt Ataranka naar Machu Picchu om de laatste levende Incakoning op te sporen. Het Orakel van Machu Picchu verhaalt over de periode voorafgaand aan de ondergang van het grote Incarijk en de oude berg Machu Picchu, die aan het begin van de twintigste eeuw werd herontdekt. Wat gebeurde er zoveel eeuwen geleden toen de Spanjaarden de macht in het land overnamen, en zijn er wellicht nog nazaten van het eens zo indrukwekkende Incavolk?