Muisje Luisje is een dierenverhaal dus het gaat over menselijke eigenschappen. Een klein muisje gaat op zoek naar antwoord op de grote vraag “wat is leven”. De uil beweert dat het bos niet leeft. Al snel leidt dit tot een zoektocht naar zaden. Zaden als bron van leven en eten voor muizen. Luis wordt geholpen en tegengewerkt door verschillende dieren en ook mensen blijken een invloed te hebben op zijn zoektocht.
De dieren hebben een eigen kijk op de werkelijkheid en gaan er dus verschillend mee om. Hoe vind luis hierin zijn weg? En hoe zit dat toch met de invloed van die mensen? Een meisje met een rood kapje lijkt een sleutelrol te hebben. Het avontuur waarin Luis op zoek gaat naar voedsel wordt verder ingekleurd door afbeeldingen die zijn opgebouwd uit verpakkingen van etenswaren