Op een broeierige zomerdag fietsen Maya en Flor door hun spookdorp, Waterdorp. Het dorp moet binnenkort plaatsmaken voor een havengebied. De meeste huizen staan al jaren leeg, de ruiten zijn gebroken en overal is er graffiti. Er lopen ook vreemde snuiters rond, zoals de Doodskoppen en de Krakers.
Dan vinden Maya en Flor een schat, zomaar, in de berm. Net op dat moment komt er een Doodskop naar buiten. Maya en Flor gaan ervandoor en verbergen hun vondst in een schuurtje. De volgende dag is de schat verdwenen...
Er hangt nog meer onweer in de lucht. Wil de vader van Maya eigenlijk wel verhuizen? En is het toevallig dat Flor opeens een nieuwe fiets heeft?

Wolken boven Waterdorp is een grappig en spannend verhaal over vriendschap, samenleven en de waarde van kromme komkommers. Bekroond auteur HILDE VANDERMEEREN schreef eerder al Camping Zeevos, Operatie Bernie Buiten, Het uitzonderlijke leven van Violetta Vonk, Een huis om in te verdwalen, Maankind en de detectivereeks Nachtraven.