Tijdens een warme zomernacht roept Jasper Jones de hulp in van Charlie Bucktin. Jasper is de schelm van het dorp die altijd overal de schuld van krijgt, Charlie is een dertienjarige wijsneus die ervan droomt schrijver te worden. Die nacht zijn ze getuige van de verdwijning van hun dorpsgenoot Laura, en door dit gedeelde geheim ontstaat er een ongewone vriendschap tussen beide jongens. Die lange hete zomer van 1965 broeit er onrust in het dorp en speculeren kinderen en volwassenen over het verdwenen meisje. Het is de zomer waarin Charlie voor het eerst verliefd wordt en in opstand komt tegen zijn ouders. Jasper gaat op zijn beurt de strijd aan met zijn verleden en de vooroordelen die zijn leven beheersen. Samen ontdekken ze langzaam de waarheid over Laura en doen een grote stap op hun weg naar volwassenheid.